Саботковци – село в Габровски окръг

Саламврия – Евдоксиопол

Салона – град на Адриатическо море

Самоков – град в Софийска област

Свищов – град на Дунава

Сексантаприста – дн. Русе

Секуриска – дн. Черковица, Никополско

Сердика – вж. София

Силистра – град край Дунава, областен център. Други названия: Дуросторум, Доростол, Дръстър.

Сингидун – вж. Белград

Сирмиум – дн. Сремска Митровица. Други названия: Срем, Сирмий.

Скампия – дн. Елбасан

Сливен – град в България, областен център.

Смолян – град в България, областен център.

Созопол – град в България край Черно море. Други названия: Аполония.

Солун – град, днес в Гърция. Друго название: Тесалоника.

София – столицата на България. Други названия – Сердика, Средец, Триадица.

Спалто – дн. Сплит.

Сплит – град на Адриатическото крайбрежие. Други названия – Спалто.

Средец – 1. дн. София 2. дн. Средец – град в Бургаска област (Грудово) 3. Хълм на който се намира крепостта Кокалянски Урвич

Стагос – дн. Каламбака

Стара Загора – град в България. Други названия: Берое, Траяна Августа.

Стоби – крепост, значим древен град, който понастоящем е в руини

Струга – селище на брега на Охридското езеро

Суки – Траянови врата